ในวาระเริ่ มแรก ให้คณะกรรมการบริหารหน่วยบริหารและจัดการทุน และผู้ อำนวยการหน่วยบริหารและจัดการทุนตามข้อบังคับคณะกรรมการอำนวยการสำนักงาน สภานโยบายการอุดมศึกษา วิทยาศาสตร์ วิจัยและนวัตกรรมแห่งชาติ ว่าด้วยหน่วยบริหารและจัดการทุน พ.ศ. ๒๕๖๒ ซึ่ งดำรงตำแหน่งอยู่ ในวันก่อนวันที่ พระราชกฤษฎีกานี้ ใช้บังคับ ปฏิบัติ หน้าที่ ตามพระราชกฤษฎีกานี้ไปพลางก่อนจนกว่าจะมีการแต่งตั้งคณะอนุกรรมการประจำหน่วยบริหารจัดการทุน และผู้ อำนวยการหน่วยบริหารจัดการทุนตามพระราชกฤษฎีกานี้ ซึ่ งต้องไม่เกินสองร้อยสี่ สิบวัน นับแต่วันที่พระราชกฤษฎีกานี้ใช้บังคับ โดยให้ เล่ม ๑๔๒ ตอนที่ ๙๒ ก ราชกิจจานุเบกษา ๓๑ ธันวาคม ๒๕๖๘
(๑) คณะกรรมการบริหารหน่วยบริหารและจัดการทุนและผู้ อำนวยการหน่วยบริหาร และจัดการทุนด้านการเพิ่มความสามารถในการแข่งขันของประเทศ ปฏิบัติหน้าที่คณะอนุกรรมการ ประจำหน่วยบริหารจัดการทุนและผู้อำนวยการหน่วยบริหารจัดการทุนด้านการเพิ่มความสามารถ การแข่งขันตามมาตรา ๓๖ (๑)
(๒) คณะกรรมการบริหารหน่วยบริหารและจัดการทุนและผู้ อำนวยการหน่วยบริหาร และจัดการทุนด้านการพัฒนาระดับพื้นที่ ปฏิบัติหน้าที่คณะอนุกรรมการประจำหน่วยบริหารจัดการทุน และผู้อำนวยการหน่วยบริหารจัดการทุนด้านการพัฒนาพื้นที่ตามมาตรา ๓๖ (๒)
(๓) คณะกรรมการบริหารหน่วยบริหารและจัดการทุนและผู้ อำนวยการหน่วยบริหาร และจัดการทุนด้านการพัฒนากำลังคน และทุนด้านการพัฒนาสถาบันอุดมศึกษา การวิจัยและการสร้างนวัตกรรม ปฏิบัติหน้าที่คณะอนุกรรมการประจำหน่วยบริหารจัดการทุนและผู้อำนวยการหน่วยบริหารจัดการทุน ด้านเทคโนโลยีและนวัตกรรมเพื่ออุตสาหกรรมแห่งอนาคตตามมาตรา ๓๖ (๓)