นอกจากการพ้นจากตำแหน่งตามวาระเลขาธิการพ้นจากตำแหน่งเมื่อ
(๑) ตาย
(๒) ลาออก
(๓) มีอายุครบหกสิบปีบริบูรณ์
(๔) ขาดคุณสมบัติหรือมีลกษณะต้องห้ามตามมาตรา ๒๑ (๕)๒๖ คณะรัฐมนตรีมีมติให้ออกโดยคำแนะนำของรัฐมนตรี ตามข้อเสนอแนะของ ก.ล.ต. เพราะบกพร่องในหน้าที่อย่างร้ายแรง หรือหย่อนความสามารถโดยมติดังกล่าว ต้องแสดงเหตุผลในการให้ออกอย่างชัดแจ้ง มาตรา ๒๒/๑๒๗ ภายในสองปีนับแต่วันพ้นจากตำแหน่ง เลขาธิการจะประกอบ ธุรกิจหรือทำงานให้แก่ผู้ประกอบการ องค์กร หรือบริษัท หรือดำรงตำแหน่งที่กำหนดไว้ตามมาตรา ๑๖/๒วรรคหนึ่ง มิได้ มาตรา ๒๐แก้ไขเพิ่มเติมโดยพระราชบัญญัติหลักทรัพย์และตลาดหลักทรัพย์ (ฉบับที่ ๔) พ.ศ. ๒๕๕๑ มาตรา ๒๒(๕) แก้ไขเพิ่มเติมโดยพระราชบัญญัติหลักทรัพย์และตลาดหลักทรัพย์ (ฉบับที่ ๔) พ.ศ. ๒๕๕๑ มาตรา ๒๒/๑เพิ่ โดยพระราชบัญญัติหลักทรัพย์และตลาดหลัทรัพย์ (ฉบับที่ ๔) พ.ศ. ๒๕๕๑ - - ในการพิจารณากำหนดเงินเดือนและเงินอื่นใดของเลขาธิการ ให้ำนึงถึงข้อห้ามมิให้ ประกอบอาชีพตามวรรคหนึ่งด้วย