นอกจากการพ้นจากตำแหน่งตามวาระตามมาตรา ๒๖ เลขาธิการพ้นจาก ตำแหน่งเมื่อ
(๑) ตาย
(๒) มีอายุครบหกสิบปี
(๓) ลาออก
(๔) ขาดคุณสมบัติหรือมีลักษณะต้องห้ามตามมาตรา ๒๕วรรคสอง เล่ม ๑๒๗ ตอนที่ ๗๑ ก ราชกิจจานุเบกษา ๑๙ พฤศจิกายน ๒๕๕๓
(๕) คณะกรรมการมีมติด้วยคะแนนเสียงไม่น้อยกว่าสองในสามของจำนวนกรรมการ ทั้งหมดให้ออกเพราะมีความประพฤติเสื่อมเสียอย่างร้ายแรง บกพร่องในหน้าที่อย่างร้ายแรง หรือไม่ สามารถปฏิบัติหน้าที่ได้