ในหน่วยบริหารจัดการทุนแต่ละหน่วย ให้คณะกรรมการแต่งตั้ง คณะอนุกรรมการประจำหน่วย ประกอบด้วย เล่ม ๑๔๒ ตอนที่ ๙๒ ก ราชกิจจานุเบกษา ๓๑ ธันวาคม ๒๕๖๘
(๑) ประธานอนุกรรมการประจำหน่วย ซึ่งแต่งตั้งจากกรรมการผู้ทรงคุณวุฒิในคณะกรรมการ ที่มีความรู้และประสบการณ์ตามภารกิจของหน่วยบริหารจัดการทุน
(๒) ผู้อำนวยการ เป็นอนุกรรมการโดยตำแหน่ง
(๓) อนุกรรมการผู้ทรงคุณวุฒิ จำนวนสองคน ซึ่งแต่งตั้งจากผู้มีความรู้ ความเชี่ยวชาญ และประสบการณ์ในด้านที่เกี่ยวข้องกับหน่วยบริหารจัดการทุนนั้น และเป็นผู้ซึ่งอาจใช้ประโยชน์ ผลงานวิจัยและนวัตกรรมของหน่วยบริหารจัดการทุน ให้ผู้อำนวยการหน่วยเป็นอนุกรรมการและเลขานุการโดยตำแหน่ง คณะอนุกรรมการประจำหน่วยอาจแต่งตั้งที่ปรึกษาของคณะอนุกรรมการประจำหน่วยได้ จำนวนไม่เกินสามคน ประธานอนุกรรมการประจำหน่วย อนุกรรมการผู้ทรงคุณวุฒิประจำหน่วย และที่ปรึกษา ของคณะอนุกรรมการประจำหน่วยให้มีวาระการดำรงตำแหน่งตามวาระของคณะกรรมการ ให้นำความในมาตรา ๑๖ วรรคสอง และมาตรา ๑๙ มาใช้บังคับแก่การพ้นจากตำแหน่ง ของประธานอนุกรรมการประจำหน่วยและอนุกรรมการผู้ทรงคุณวุฒิประจำหน่วยด้วยโดยอนุโลม